Pii se věnuje primárně projektům, které zlepšují inovační ekosystém jako celek. Zárovň nás zajímají pilotní projekty, které pomáhají převést výsledky výzkumu do praxe, přispívají k rozvoji vzdělávání a udržitelnosti v Praze. Klíčovými jsou systémové projekty Prague Smart Accelerator z výzev OP VVV a OP JAK. K dalším patří především inovace ve vzdělávání v propjetech iKAP II a iDZ, Školská inkluzivní koncepce pro HMP a strategie Cirkulární ekonomiky. Z pilotních projektů je zásadní vývoj aplikace pro sledování kognitivních funkcí Cogni Trainee z výzvy OP PPR.